جداسازی متانوبروی باکتر اسمیتی از نمونه مدفوع انسان با استفاده از ژن اختصاصی rpoB

نویسندگان

  • اخوان سپهی, عباس گروه میکروب شناسی، دانشگاه آزاد اسلامی، واحد تهران شمال
  • اسدزاده عقدایی, حمید ، فوق تخصص گوارش و کبد ، مرکز تحقیقات علوم پایه و اپیدمولوژی بیماری‌های دستگاه گوارش، پژوهشکده بیماری‌های گوارش و کبد، دانشگاه علوم پزشکی شهید بهشتی
  • برادران قوامی , شقایق دکتری میکروب شناسی،گروه زیست شناسی، دانشگاه آزاد اسلامی، واحد علوم تحقیقات تهران
  • زالی , محمدرضا فوق تخصص گوارش وکبد، مرکز تحقیقات بیماری‌های گوارش و کبد، پژوهشکده بیماری‌های گوارش و کبد، دانشگاه علوم پزشکی شهید بهشتی
  • نژادستاری, طاهر گروه زیست شناسی، دانشگاه آزاد اسلامی، واحد علوم تحقیقات تهران
چکیده مقاله:

سابقه و هدف: آرکی­ها میکروارگانیسم­های اکستروترموفیل هستند که سال­ها تصور بر آن بود که تنها می­توان آنها از محیط­های با شرایط دشوار از قبیل آتشفشان­ها ، اعماق اقیانوس­های و دریاچه­های پرنمک به دست آورد. اما امروزه مشخص شده است که دسته­ای از این آرکی­ها ساکن دستگاه گوارش موجودات زنده از قبیل پستانداران، سخت پوستان و انسان هستند. از مهم­ترین سویه شناسایی شده آرکی­ها در دستگاه گوارش، می توان بهMethanobrevibacter smithii   اشاره کرد. در این مطالعه، برای اولین بار آرکی متانوژن به صورت بومی جداسازی شد. روش بررسی: در این مطالعه DNA آرکی از نمونه های مدفوع 20 فرد سالم با معیار های مورد نظراستخراج  و سپس PCR  آن در شرایط بهینه صورت گرفت، همچنین برای اطمینان از تکثیر ژن مورد نظر (rpoB) هضم آنزیمی توسط آنزیم محدودکننده انجام شد و در انتها نمونه ها در داخل E.coli(DH5α) کلون و تعیین توالی شدند. یافته­ ها: از بین 20 نمونه مدفوع، در 18 نمونه جواب PCR (90%) مثبت گزارش شد. جواب­های مثبت به کمک آنزیم محدودالاثر AVAII تایید شدند و نتایج سکانس در سایت NBCI بررسی شد و مشخص شد نمونه جدا شده آرکی Methanobrevibacter smithii  است. نتیجه­گیری: این مطالعه نشان می­دهد با توجه به  تنوع میکرورارگانیسم­ها در دستگاه گوارش، تعیین ژن اختصاصی و عدم داشتن همولوژی با سایر میکروارگانیسم­ها در جداسازی آرکی بسیار حایز اهمیت است. واژگان کلیدی: متانوبروی باکتر اسمیتی، آرکی، مدفوع ، ژن rpoB.

برای دانلود باید عضویت طلایی داشته باشید

برای دانلود متن کامل این مقاله و بیش از 32 میلیون مقاله دیگر ابتدا ثبت نام کنید

اگر عضو سایت هستید لطفا وارد حساب کاربری خود شوید

منابع مشابه

جداسازی متانوبروی باکتر اسمیتی از نمونه مدفوع انسان با استفاده از ژن اختصاصی rpob

سابقه و هدف: آرکی­ها میکروارگانیسم­های اکستروترموفیل هستند که سال­ها تصور بر آن بود که تنها می­توان آنها از محیط­های با شرایط دشوار از قبیل آتشفشان­ها ، اعماق اقیانوس­های و دریاچه­های پرنمک به دست آورد. اما امروزه مشخص شده است که دسته­ای از این آرکی­ها ساکن دستگاه گوارش موجودات زنده از قبیل پستانداران، سخت پوستان و انسان هستند. از مهم­ترین سویه شناسایی شده آرکی­ها در دستگاه گوارش، می توان بهmet...

متن کامل

جداسازی مولکولی سالمونلا از مدفوع گربه‌های ولگرد شهر تهران با استفاده از روش زنجیره‌ای پلی مراز

این بررسی به منظور اطلاع از میزان آلودگی مدفوعگربه­های ولگرد سطح شهر تهران به سالمونلا طراحی و انجام گردید. جهت نیل به این هدف از 100 قلاده گربه ولگرد که توسط افراد حامی حیوانات از مناطق مختلف شهر تهران به کلینیک­های دامپزشکی منتخب ارجاع داده شده بودند، نمونه­برداری از مدفوع صورت پذیرفت. از سه روش کشت معمول، آزمون­های سروتایپینگ و روش­های مولکولی واکنش­های زنجیره­ای پلیمراز تک گانه و چندگانه جه...

متن کامل

سینتیک و ترمودینامیک جداسازی روی از یک نمونه پساب صنایع آبکاری با استفاده از زئولیت فیروزکوه

کانی زئولیت از جمله کانی‌های فراوان و ارزان‌قیمت در مناطق خشک دنیاست که به علت ویژگی‌‌های ساختاری، قدرت جذب‌کنندگی بسیار زیادی دارد. این مطالعه به منظور بررسی کارایی کانی زئولیت فیروزکوه در حذف آلایندگی عنصر روی از یک نمونه پساب صنایع آبکاری و بررسی تأثیر عوامل مختلفی مانند مدت زمان تماس بین جاذب و آلاینده (۵، ۱۰، ۱۵، ۲۰، ۳۰، ۶۰، ۱۲۰، ۲۴۰، ۴۸۰، ۷۲۰، ۱۴۴۰ و ۲۸۸۰ دقیقه)، دمای محلول (20، 30 و 40 د...

متن کامل

تشخیص ژن اختصاصی eae باکتری انتروپاتوژنیک اشرشیاکلی با استفاده از روش نوین PCR-ELISA

Background and purpose: Enteropathogenic Escherichia coli from Enterobacteriaceae family is one of the most common causes of chronic diarrhea in children and infants. Polymerase Chain Reaction (PCR) method is commonly used for detection of enteropathogenic Escherichia coli species, but there are some disadvantages with this method due to the use of gel electrophoresis and staining with ethidium...

متن کامل

مقایسه شش روش کشت باکتریایی برای جداسازی سالمونلا از نمونه های مدفوع طیور

چکیده زمینه و هدف: سالمونلوزیمی یکی از مهمترین بیماری های مشترک دام و انسان با منشا غذایی در جهان به شمار می رود و طیور و فرآورده های آن مهمترین منبع عفونت سالمونلایی در انسان هستند. شناسایی طیور آلوده نیاز به کشت مدفوع در محیط های کشت غنی کننده و انتخابی دارد که در این مطالعه کارایی محیط های مختلف در جداسازی سالمونلا از مدفوع طیور با هم مقایسه شده است. روش بررسی: بعد از مشخص کردن سالن های آلود...

متن کامل

The effect of cyclosporine on asymmetric antibodies and serum transforming growth factor beta1 in abortion-prone model of mice CBA/J x DBA/2

كچ ي هد فده و هقباس : ي ک ي طقس زورب للع زا اه ي ،ررکم ا لماوع تلاخد ي ژولونوم ي ک ا رد ي ن قم طققس عون ي وراد دقشاب ي س ي روپسولک ي ،ن ح لدم رد طقس شهاک بجوم ي ناو ي CBA/j×DBA/2 م ي تنآ ددرگ ي داب ي اه ي ان و راققتم TGF-β لماوع زا عت مهم يي ن گلماح تشونرس هدننک ي سررب روظنم هب رضاح هعلاطم تسا ي ات ث ي ر اس ي روپسولک ي ن م رب ي از ا ي ن تنآ عون ي داب ي س و اه ي اکوت ي ن TGF...

متن کامل

منابع من

با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید

ذخیره در منابع من قبلا به منابع من ذحیره شده

{@ msg_add @}


عنوان ژورنال

دوره 26  شماره 2

صفحات  82- 88

تاریخ انتشار 2016-06

با دنبال کردن یک ژورنال هنگامی که شماره جدید این ژورنال منتشر می شود به شما از طریق ایمیل اطلاع داده می شود.

کلمات کلیدی

کلمات کلیدی برای این مقاله ارائه نشده است

میزبانی شده توسط پلتفرم ابری doprax.com

copyright © 2015-2023